Windows2000的磁盤分區(qū)包括三種文件系統(tǒng)：NTFS、FAT和FAT32。 FAT和FAT32非常相似，只是FAT32更適合容量更大的硬盤。 NTFS 文件系統(tǒng)比FAT 和FAT32 更強大。

如果要在Windows2000和更早的操作系統(tǒng)之間建立多重引導，則需要使用FAT或FAT32文件系統(tǒng)。在這種情況下，用戶應將系統(tǒng)配置為多重啟動，并使用FAT 或FAT32 分區(qū)作為硬盤上的活動分區(qū)。這是因為早期的操作系統(tǒng)無法訪問NTFS 格式的本地硬盤分區(qū)。如果服務器不需要配置多重啟動功能，用戶最好使用NTFS格式的文件系統(tǒng)。

NTFS文件系統(tǒng)包括了公司環(huán)境中文件服務器和高端個人網(wǎng)站制作所需的安全特性。NTFS文件系統(tǒng)還支持對于關鍵數(shù)據(jù)完整性十分重要的數(shù)據(jù)訪問控制和私有權(quán)限。除了可以賦予Windows?2000計算機中的共享文件夾特定權(quán)限外，NTFS文件和文件夾無論共享與否都可以賦予權(quán)限。NTFS是Windows?2000?中唯一允許為單個文件指定權(quán)限的文件系統(tǒng)。然而，當用戶從NTFS卷移動或復制文件到FAT卷時，NTFS文件系統(tǒng)權(quán)限和其它特有屬性將會丟失。

像FAT文件系統(tǒng)一樣，NTFS文件系統(tǒng)使用簇作為磁盤分配的基本單元。在NTFS文件系統(tǒng)中，默認的簇大小取決于卷的大小。在“磁盤管理器”中，用戶可以指定的簇大小最大為4k。

Windows?2000包括一個新版本的NTFS，該文件系統(tǒng)在原有的靈活的安全特性（比如域和用戶賬戶數(shù)據(jù)庫）之上又加入了新的特性，如活動目錄(Active?Directory)Windows?2000中使用的NTFS文件系統(tǒng)支持以下特性：

??活動目錄。使網(wǎng)絡管理者和網(wǎng)絡用戶可以方便靈活地查看和控制網(wǎng)絡資源。

??域。它是活動目錄的一部分，幫助網(wǎng)絡管理者兼顧管理的簡單性和網(wǎng)絡的安全性。例如，只有在NTFS文件系統(tǒng)中用戶才能設置單個文件的許可權(quán)限而不僅僅是目錄的許可權(quán)限。

??文件加密。能夠大大提高信息的安全性。

??稀松文件。應用程序生成的一種特殊文件，它的文件尺寸非常大，但實際上只需要少部分的磁盤空間。就是說，NTFS只需要給這種文件實際寫入的數(shù)據(jù)分配磁盤存儲空間。

??其他的數(shù)據(jù)存儲模式。這些模式可以提高存儲和修改信息的效率。

??磁盤活動的恢復日志。它將幫助用戶在電源失效或其他系統(tǒng)故障時快速恢復信息。

??磁盤配額。管理者可以管理和控制每個用戶所能使用的最大磁盤空間。

??對于大容量驅(qū)動器的良好擴展性。NTFS中最大驅(qū)動器的尺寸遠遠大于FAT格式的，而且，NTFS的性能和存儲效率并不象FAT那樣隨著驅(qū)動器尺寸的增大而降低。

NTFS文件系統(tǒng)是使用Windows?2000所推薦的文件系統(tǒng)。NTFS具有FAT文件系統(tǒng)的所有基本功能，并且提供如下的FAT或FAT32文件系統(tǒng)所沒有的優(yōu)點：

??更為安全的文件。

??更好的磁盤壓縮性能。

??支持最大達2TB的大硬盤（NTFS可支持的最大磁盤容量比FAT的大得多，而且隨著磁盤容量的增大，NTFS的性能不像FAT那樣隨之降低）。

??雙重啟動配置（在同一臺計算機上同時安裝有Windows?2000和其他操作系統(tǒng)）。

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